Se dictan las siguientes Carreras, Maestrías, Cursos, Postgrados y Doctorados:
- Facultad de Derecho y Ciencias Sociales
- Facultad de Contaduría y Administración
- Facultad de Arquitectura 5 de Mayo
- Facultad de Arquitectura C.U.
- Facultad de Idiomas
- Facultad de Odontología
- Facultad de Ciencias Químicas
- Facultad de Medicina y Cirugía
- Facultad de Enfermería y Obstetricia Oaxaca
- Instituto de Ciencias de la Educación
- Instituto de Investigaciones Sociológicas
- Instituto de Investigaciones en Humanidades
- Escuela de Ciencias
- Escuela de Bellas Artes
- Escuela de Medicina Veterinaria y Zootecnia
- Escuela de Economía
- Escuela de Enfermería Huajuapan
- Escuela de Enfermería Tehuantepec
- Escuela de Entrenamiento Deportivo